Geenitestit

Geenitestit ja niiden merkitys

Geenitestejä tehdään kooikkerhondjeille kahta eri käyttötarkoitusta varten:

  1. Perinnöllisten sairauksien testausta varten (ENM, PM, vWd). Tämä auttaa jalostuksessa ehkäisemään siirtymistä jälkeläisille. Testillä voidaan selvittää myös yhden ykslön riskiä sairastua esimerkiksi polymyosiittiin (PM).
  2. Geneettisen monimuotoisuuden kartoittamiseksi. Testeillä saadaan seurattua rodun sisäsiittoisuuden kehittymistä. Lisäksi voidaan jalostuksessa etsiä geneettisesti mahdollisimman erilainen uros ja narttu pariksi, jotta pennuista saadaan mahdollisimman monimuotoisia. Monimuotoisella yksilöllä on pienempi riski sairastua perinnöllisiin sairauksiin. Näissä valinnoissa auttaa Fit2breed-ohjelman Genotype matchmaking -toiminnallisuus.

Testaaminen

Uusi testi tuo mukanaan monta hyötyä!

Vuoden 2025 alusta alkaen kaikki kooikerhondjeille Hollannin rotuyhdistyksen (VHNK) suositelemat testit saa nyt yhdellä poskisolunäytteellä. Testi on koiralle kivuton, kaikki tarvittavat testit saadaan yhdellä testauksella ja testi voidaan tehdä jo pentuna, esim. tunnistusmerkinnän yhteydessä. Jatkossa ei myöskään tarvita enää Embark-testien lähettämiseen liittynyttä tullausta, koska testit lähetetään eurooppalaiseen laboratorioon (myös nopeampi postin kulku). Tulosten on luvattu valmistuvan 10 päivässä näytteen saapumisesta laboratorioon, joten nyt pennut on mahdollista testata laajasti jo ennen luovutusikää.

Testin tilaaminen

Tilaa uudet DNA-testit VHNK:n verkkosivuilta: https://survey.uu.nl/jfe/form/SV_5bYsJ3YJIdgj4O2 

  • Kaikki edellä mainitut testit sisältävä paketti: H561 Combibreed Kooiker (this package contains the SNP-genotyping for Fit2Breed and the DNA tests for PM, ENM and VWD) - €193.15 incl VAT (tarkista ajantasainen hinta tilauksen yhteydessä). Huom.! Tästä paketista puuttu FGF4 (IVDD) -testi, joka ei kuulu virallisiin suosituksiin, mutta josta olemme Suomessa hyvin kiinnostuneita.
  • Lomakkeella on mainittu myös muita vaihtoehtoja. Näistä voi löytyä sopiva, mikäli koirallesi on aiemmin jo tehty osa testeistä.

Nettilomakkeella annetaan lupa jakaa testitulokset VHNK:lle ja Fit2breed-järjestelmään sekä tutkimustyössä käytettäväksi. Lomakkeen täytön jälkeen sinut ohjataan CombiBreedin sivulle tekemään mahdollinen tilaus.

Halustessasi voit tilata myös jonkin yksittäisen testin tai yhdistelmän eri testejä Combibreedin sivuilta. Täytä myös tällöin yllä olevasta linkistä löytyvä lomake tietojen luovuttamista varten ja tilaa sitten haluamasi testit erikseen Combibreedin sivuilta.

VHNK:n info-sivu testeistä: https://www.kooikerhondje.nl/en/breeding/request-dna-tests/ 

Mistä löytyy kooikkereiden geenitestitulokset?

Jatkossa kaikki VHNK:n tilauslomakkeella ilmoitetut ja CombiBreedin kautta tilatut geenitestitulokset menevät automaattisesti suoraan Fit2breed-ohjelmaan. Tuloksia ei enää päivitetä erikseen ClubRegisteriin eli niitä ei tarvitse ilmoittaa enää erikseen yhdistyksellemme. Eli Fit2breedistä löytyy ENM, vWd ja polymyosiitti-tulokset, mikäli omistaja on antanut luvan niiden julkaisuun webbilomakkeella testiä tilatessaan.

FGF4 (IVDD) -testi

FGF4-retrogeeniä, joka altistaa välilevykalkkeumille ja välilevytyrille voi testata geenitestillä. Valitettavasti tämä testi ei sisälly Hollannin tarjoamaan kooikerhondjen testipakettiin. Testi ei ainakaan vielä myöskään kuulu Suomen kooikerhondje ry:n jalostuksen tavoiteohjelman suosituksiin. Suomalaiset koirien omistajat ja kasvattajat ovat kuitenkin olleet edelläkävijöitä tämän retrogeenin testauksessa ja näin on saatu arvokasta tietoa tämän retrogeenin esiitymisestä ja merkittävyydestä rodullemme.

IVDD:n testauksen vaihtoehtoja ovat jatkossa:

  • CombiBreed: Muun geenitestauksen lisäksi tilaa samasta näytteestä tehtäväksi myös IVDD:testin (H346 Chondrodystrophy (CDDY with IVDD Risk))
  • MyDog DNA / Wisdom Panel: Tilaa erillisen testipaneelin täältä. Sisältää myös laajan paneelin muita testejä. Tämän testitulos pitäisi olla luotettava FGF4-retrogeenin osalta. Tehdään poskisolunäytteestä. Ajoittain hyviä tarjouksia.
  • Labogen. Mahdollista tilata vain CDPA:ta ja IVDD:tä mittaava testi.
  • Muut laboratoriot. Geenitestejä tarjoaa jatkuvasti kasvava määrä laboratorioita. Periaatteessa testin voi tilata muistakin laboratorioista. On hyvä huomata, että osa laboratorioista testaa suoraan retrogeenin esiintymistä ja osa testaa markkereita, jotka liittyvät retrogeenin esiitymiseen. Suorat testit ovat luotettavampia kuin markkereita testaavat testit (linked test).

Lähetä tulos yhdistykselle

Koska näitä IVDD testituloksia ei tällä hetkellä rekisteröidä mihinkään kansainvälisesti yhteiseen rekisteriin, pyydämme lähettämään näistä tuloksista tiedon yhdistyksemme terveyskyselylomakkeella.

Monimuotoisuuden testaaminen - Embark

EMBARK ei ole enää virallisesti Hollannin rotuyhdistyksen suosittelema testipaketti. Lisäksi on hyvä huomata, että FGF4 (IVDD) -testin tulos ei ole täysin luotettava Embarkin testipaketissa. Paketteja lienee vielä tovin tilattavissa kuitenkin VHNK:n kautta niin kauan kuin tilauksen voi tehdä lomakkeella: Qualtrics Survey | Qualtrics Experience Management (uu.nl).

  • Saat muutaman viikon kuluessa näytteenottopaketin (poskisoluharjan, näyteputken, lähetelomakkeen ja palautuskuoret) ilmoittamaasi osoitteeseen.
  • Virallisen tuloksen saadaksesi eläinlääkärin on otettava poskisolunäyte. Vain viralliset tulokset tallennetaan jalostuksen tukena olevaan Fit2breed -tietokantaan.
  • Kun eläinlääkäri on ottanut näytteen, näyte postitetaan Yhdysvaltoihin mukana tulleessa palautuspussissa.
    HUOMAA! Suomesta postitettaessa:
  • Muutaman viikon päästä saat sähköpostiin viestin, josta pääset katsomaan koirasi testien tulokset Embarkin palvelusta.
  • Myöhemmin Utrecht lataa suoraan Embarkilta tulokset Fit2breediin eikä tämä vaadi sinulta toimenpiteitä kunhan olet antanut luvan tulosten käyttöön.

Lisätietoa aiheesta:

Toivomme, että lähetät koko Embark-testitulostiedoston jalostustoimikunnan selvityksissä käytettäväksi. Testitulokset löytyvät pdf-tiedostona Embark-tililtäsi: 

Embark tilisi etusivu --> Valitse koira --> Koiran oman sivun ihan alhaalla linkki: Add to her profile --> Avautuvan sivun ihan alalaidasta Summary --> Full report 

Tallenna tuolta löytyvä tiedosto ensin omalle koneellesi ja lähetä se sitten alla olevalla lomakkeella. Pystyt lähettämään useamman koiran tulokset lataamalla sivun uudelleen (refresh) aina yhden tuloksen lähettämisen jälkeen.